DrosoWing

DrosoWing is a web based application software that identifies Drosophila species among 16 species commonly observed in Tokyo area using wing image. このサイトでは、翅画像を撮影しブラウザ上で翅脈の交点をクリックすることでショウジョウバエの種を調べることができます。
現在、日本の東京都多摩地区で採集できる主な 16 種を分類することができます。

Step 1. Load a wing image file Step 1. ショウジョウバエの翅の写真を読み込む

To use this software, the users have to prepare a wing image file (jpg, png, etc. supported by the web browser). If you do not have a image file, you can try the software using the test image of Drosophila immigrans. まずは、採集したショウジョウバエの翅サンプルを作成し写真を撮りましょう。
手元に翅写真が無い場合は、お試しで使えるテスト画像を用意しています。

ショウジョウバエの翅写真を撮影するには

Fly species to be identified 現在判別可能な種

• Dichaetophora acutissima
• Drosophila annulipes
• Drosophila bizonata
• Drosophila busckii
• Drosophila curviceps
• Drosophila hydei
• Drosophila immigrans
• Drosophila lutescens
• Drosophila rufa
• Drosophila sternopleuralis
• Drosophila suzukii
• Hirtodrosophila sexvittata
• Liodrosophila aerea
• Microdrosophila sp.
• Scaptodrosophila coracina
• Scaptomyza graminum

Downloads

• Software (Java app with template dataset, 66.9 MB)
• Image database (600 images, 727 MB)
• Additional image database (359 images, 932 MB)

Citation

• Sheng Yang Michael Loh, Yoshitaka Ogawa, Sara Kawana, Koichiro Tamura and Hwee Kuan Lee (2017) Semi-automated Quantitative Drosophila Wings Measurements. BMC Bioinformatics. doi:10.1186/s12859-017-1720-y

Contact

Hwee Kuan Lee leehk@bii.a-star.edu.sg
Koichiro Tamura ktamura@tmu.ac.jp (web application and images)

Step 2. Specify landmarks Step 2. 特徴的な 3 点を順番にクリックする

Click three landmarks as below. These points are required to detect other vein landmarks. Then, click "Go Next" button. サンプル写真を参考にしながら、以下に記した 3 点を順番にクリックしてください。
3 点をクリックしたら、「次に進む」ボタンを押して次のステップに進んでください。

1. The intersection near the wing base. 翅の付け根部分にある翅脈の交点
2. The intersection on the posterior fringe. 翅の下部分にある翅脈の交点
3. The point of ending bristles along the anterior fringe. 翅の周縁部に生えている太く顕著な縁毛が途切れているところ

Step 3. Adjust the positions of landmarks Step 3. 翅脈の交点の位置を確認する

Ten intersections of veins have been detected based on three landmarks specified. If you need, mouse drag to adjust the positions of these intersections. Then, click the "Go Next" button. 翅の写真と 3 点の情報から、種の判別に必要なその他の 10 点の位置が自動的に検出されました。
十字マークの位置と実際の交点の位置がずれている場合は、手作業で修整してから、次のステップに進んでください。
十字マークはドラッグして動かせます。

Step 4. Fit polylines to shapes of veins Step 4. ポリラインを翅脈の形に合わせる

Finally, adjust the vertices to fit the polylines to veins for an accurate measure of the curve length. Then, click the "Go Next" button. 種の判別に必要な最後のデータは 4 か所の翅脈の長さです。
ポリラインの頂点になっている四角形をドラッグして動かし、ポリラインができるだけ翅脈の形状に沿うようにしてください。
問題なければ、次のステップに進んでください。これまでのデータから種を判別します。

Result: 結果： Unknown 不明

The relatively closed species among database was データベース内で比較的近い種は . でした。

Details 詳細

Filename: ファイル名： The test image (Drosophila immigrans) テスト画像 (Drosophila immigrans)

Parameters パラメーター	Your Data 今回のデータ	Population Mean (± SD) 種平均 (± 標準偏差)
Mahalanobis distance = マハラノビスの距離 = (p ; chi-squared testカイ二乗検定)

Possible alternative species 次点の候補

Other Tasks その他

Save the result as CSV 測定結果を保存する

Select another wing image 翅写真の選択からやり直す