[P-107]縦列配列情報を用いた鳥型結核菌の系統発生学的解析

発表者（所属）

西森敬，田中聖、西森　知子、菅野　徹、石原　涼子、内田郁夫（動衛研・北海道）

要旨

鳥型結核菌は血清型、生化学的性状、遺伝子挿入配列解析，DNAフィンガープリントあるいは16S rDNA解析などにより，４つの亜種が提案されている。我々は鳥型結核菌のゲノムプロジェクトにて逐次的に公開されたシークエンス情報と人型結核菌の縦列配列情報から１９ヶ所の縦列配列領域を特定し，鳥型結核菌の参照株および野外株のアリルプロファイルを得た。このうち，全株について情報の得られた１５ヶ所のアリルプロファイル情報について対応する領域の縦列配列の反復数の差を累計して各株間の距離行列を求め，UPGMA、Fitch and Margoliash法あるいは近接結合法 等で系統樹を推定した。遺伝子挿入配列IS900を保有するヨーネ菌亜種やIS901を保有するavium亜種と推定される菌株がそれぞれクラスターを形成し、最近提案されているhominissuis亜種に属すると推定される菌株がさらに幾つかのクラスターに別れる事が示唆された。