系統間での比較ゲノム解析により、大規模なものから小規模なものまで、さまざまなゲノム構造差異が同定されてきた。これらはゲノム進化研究のための重要な手がかりであり、同時に生物進化研究における有用な系統マーカーでもある。ゲノム構造差異を生じる分子機構には、ゲノム断片の重複や欠失、逆位、不等交差、水平移行などが知られている。本ワークショップではゲノム構造進化の分子機構にせまる各種研究を紹介し、その進化学的な意義について議論したい。

１．「Evolution of endogenous Borna-like nucleoprotein elements.」
　　鈴木善幸（名古屋市立大）

２．「脊索動物ホヤにおけるセルロース合成酵素遺伝子の獲得と機能」
　　笹倉靖徳（筑波大）

３．「主要組織適合遺伝子複合体（MHC）領域のゲノム構造進化」
　　椎名　隆（東海大）

４．「近縁種ゲノム比較によって明らかにされる超微小逆位」
　　原　雄一郎・今西　規（産総研）

５．「栽培イネにおけるExon-Intron構造進化」
　　田中　剛^1,2、Georg Haberer²、Klaus Mayer²（¹生物研、²Helmholtz Zentrum München）

６．「反復配列の変異がもたらすミトコンドリアDNA調節領域の多様性と進化」
　　金城　その子、池尾一穂（遺伝研）、椎名　隆2田中景子（東海大・医）、田中　彰（東海大・海洋）、小見山 智義（東海大・医）

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　ゲノム解読のイノベーションによるゲノム情報の爆発的蓄積によって、「種とは何か？」という進化研究の根本的な問題に、１塩基対の分解能で、かつトータルにアプローチできる段階がついに来た。真核生物に先立って成立した原核生物には、様々な方法で系統関係を認めることができるが、それらはどのようにして成立したのだろうか? 「生殖隔離の単位」という生物学的な種の定義は、原核生物では「遺伝情報フロー(genetic flux)の単位」に対応するのだろうか?　しかし、蓄積しつつある原核生物の全ゲノム 配列とメタゲノム配列は、特定の生態学的ニッチに適応した遺伝子の、系統を超えた水平伝達を明らかにしている。一方、医療、バイオテクノロジー、環境など実際的な面でも、細菌の種をどう識別するかは大きな問題である。本ワークショップでは、原核生物の種の問題について、できるだけ多様な立場から自由に発言して頂き、「種とはなにか？」の理解への一歩としたい。なお、一般発表からの採択はないが、討論時間を十分にとって、多くの方々のディスカッションへの参加を期待する。

１．「原核生物の系統とは？」
　　伊藤　隆（理研）

２．「新しい系統の生命の探索」
　　藤田信之（NITE）

３．「ゲノム配列からみた系統」
　　西田洋巳 (東大)

４．「メタゲノム情報と系統分類」
　　内山郁夫（基生研）

５．「原核生物における翻訳開始機構の進化」
　　五條掘孝（遺伝研）

６．「相同組換えから見た種」
　　矢原耕史（東大）

７．「おわりに」
　　小林一三（東大）

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　生物は進化過程で様々な生理機能を獲得し、多様な環境に適応してきた。生理機能の進化過程の解明には関連する遺伝子の機能を分子、細胞あるいは個体レベルで実験的アプローチにより解析し、種間で比較する必要がある。一方、分子進化学的な配列データ解析は遺伝子の進化的な変化を時間軸で解明することを可能とする。本企画では分子進化学、生理学、分子生物学的な研究手法を統合的に用いて生理機能進化の解明を試みている演者の発表を通して、異分野の研究手法を融合した進化研究の今後の展望について議論したい。

１．「エストロゲン受容体の分子進化と機能進化」
　　勝　義直（北大・生物科学）

２．「イオンチャネル修飾サブユニットの追加による生理機能進化」
　　中條浩一（生理研・神経機能素子）

３．「Simple is the first?：微生物由来レチナール蛋白質の分子進化と多様性」
　　須藤雄気（名大・生命理学）

４．「光受容タンパク質の分子進化と生理機能との連関」
　　小柳光正（大阪市大・生物地球系）

５．「温度感受性TRPチャネルの進化：痛み受容体TRPV1とTRPA1の脊椎動物における機能進化」
　　齋藤　茂（生理研・細胞生理）

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　塩基配列の変化を伴わないエピジェネティック変異は、環境変化によってもたらされ、表現型に遺伝しうる変異を生じさせる。エピジェネティクスの制御機構やその機能はモデル生物で明らかにされつつあるが、野生生物での役割は知られていない。しかし、遺伝的変異を介さず直接表現型に影響するため、野外の変動環境での生物の適応進化に迅速でかつ重要な経路であると考えられる。本企画では野生植物に見られるエピジェネティック変異と、エピジェネティック変異によって説明されうる表現型の事例を紹介し、野生植物におけるエピジェネティック変異の役割について議論するとともに、野外生物での研究の進展に向けて話題を提供したい。

１．「クローン植物集団におけるエピジェネティック空間構造とその変異要因」
　　荒木希和子（京大・生態研）

２．「冬の記憶とエピジェネティクス：変動環境下で適切な時期に開花する仕組み」
　　佐竹暁子（北大・学地球環境科学）

３．「アサガオの模様にみるエピジェネティックな遺伝子発現制御の獲得機構」
　　星野　敦（基生研）

４．「タケ・ササ類における一斉開花枯死の周期性とそのずれ」
　　陶山佳久（東北大・農）

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　生命の発生と多様化の主舞台であった海洋が、進化学における最重要フィールドの１つであることは言うまでもない。さらに近年の大型観測船や大出力シークエンサー等の登場によって、海洋生物学の研究が多彩さを増している。このような背景を踏まえて、本ワークショップでは、若手研究者を中心に、海洋や水域に焦点をあてた研究事例を紹介していただき、進化研究の為に、改めて海洋というフィールドにアプローチしていくか考える機会としたい。

１．「水圏海洋の進化生態研究における次世代シーケンサ活用」
　　佐藤行人（遺伝研）

２．「メタゲノム解析手法による沿岸プランクトンモニタリングの実践」
　　長井　敏、安池元重、中村洋路（水研セ中央水研）、西川哲也（兵庫県但馬水技セ）、
　　藤原篤志（水研セ中央水研）

３．「時系列メタゲノムデータを用いた沿岸プランクトン動態の解析」
　　安池元重、中村洋路、甲斐　渉、藤原篤志、長井　敏（水研セ中央水研）、
　　安東秀徳（熊本県水研セ）、西　広海（鹿児島県水技セ）、小林敬典、
　　佐野元彦（水研セ中央水研）

４．「真骨魚類ゲノムの進化特性：トランスクリプトーム相同遺伝子データベースの構築」
　　井上 潤（東大・大気海洋研）

５．「深海底熱水活動域に生息する化学合成独立栄養細菌に感染するファージのゲノム解析」
　　吉田（高島）ゆかり、高木善弘、島村　繁、布浦拓郎、高井　研（海洋機構）

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　一般に、ショウジョウバエと言えばキイロショウジョウバエを指すことが多いが、本種以外にも、これまでさまざまなショウジョウバエ種が、遺伝学、行動学、生態学などの研究分野で広く用いられている。そして、それらの多様性に着目して研究を拡大する際、ショウジョウバエの系統進化に関する情報は、ショウジョウバエを用いたあらゆる研究の重要な基盤となる。本ワークショップでは、ショウジョウバエの系統分類と進化に関する最近の話題をいくつか紹介するとともに、ショウジョウバエを用いた進化学研究の今後の展望について議論する。

１．「ショウジョウバエの分類と系統：古い問題と新しい挑戦」
　　戸田正憲（北大）

２．「Drosophila亜属の系統と進化−quinaria sectionのショウジョウバエを中心に−」
　　 加藤徹（北大）・福田洋之（北大）・越川滋行（University of Wisconsin-Madison）

３．「サトイモ科植物と送粉共生を結ぶタロイモショウジョウバエの分子系統」
　　高野(竹中)宏平（地球研）・稲荷尚記（北大）・小林憲生（埼玉県立大）・加藤徹（北大）・Jian-jun Gao（雲南大）

４．「ショウジョウバエの分子系統と共生細菌」
　　和多田正義（愛媛大）

５．総合討論

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　言語能力の生物学的な意味での起源・進化，および，言語自体の文化進化の解明を目指す進化言語学は，言語学・進化生物学のみならず，言語や認知に関わるすべての分野が交わる超学際的な進化学の重要分野であり，世界的な活況を見せている．日本でも，進化学会における５回のＷSを経て，2012年春に『進化言語学の構築』の出版と「言語進化の国際会議（Evolang9）」の開催があり，本分野が構築されてきた．本シンポジウムでは，国際会議等で明らかになってきた言語の起源と進化の未解決の諸問題を中心にインテンシブな議論を行い，進化言語学をさらに展開させることを目的とする．

１．「はじめに」
　　橋本敬（北陸先端科技大）

２．「進化言語学の現状と課題：Evolang9報告」
　　岡ノ谷一夫（東大・総合文化）

３．「メタ認知と言語の進化−鳥類の実験から思うこと」
　　藤田和生（京大・文）

４．「分子生物学は言語進化にどう貢献できるか」
　　大隅典子（東北大・医）

５．「道具使用と言語の進化」
　　入來篤史（理研・脳科学）

６．「音象徴と言語の起源」
　　今井むつみ（慶應大・環境情報）

７．「総合討論：進化言語学の現状・課題を踏まえた今後の展開について」

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　ヒトゲノム配列決定から10年の間に多くの生物のゲノム配列が解読され、ゲノムの種間比較により分子進化学が大きく発展した。ところが、現在では次世代シークエンサーの発展・普及によりゲノムの種間比較から集団間比較へシフトしつつある。特に集団や個体の形態的・生態的違いを扱ってきた生態学はいよいよ分子の時代に突入したといえる。このような背景の中で進化学者は何を目指すのか? ゲノム情報を利用する生態学者、進化学者の双方から講演者を招待し活発に議論を行いたい。

１．「シロイヌナズナ生態株間の二次代謝産物の多様性をつくる分子機構の解明に向けて 」
　　花田 耕介 (理研・PSC)

２．「シロイヌナズナ近縁種の局所適応と短期的進化：ゲノムを温ねて生態を知る 」
　　森長 真一 (東大・総合文化)

３．「トゲウオにおける種分化と適応進化のゲノミックス：分子機能解析への展望 」
　　北野 潤 (遺伝研・生態遺伝)

４．「ハリヨ集団間における繁殖システム変異のエコゲノミクス 」
　　小北 智之 (福井県立大・海洋)

５．「表現型可塑性の分子機構とその進化〜エコデボ研究におけるゲノミクスの活用〜」
　　三浦 徹 (北大・環境)

６．「ゲノミクスで迫る生物が持つ環境適応能力の相違」
　　牧野 能士 (東北大・生命)

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　タンパク質は「Magic 20」と称される20種のアミノ酸の重合体である。生物３ドメインにおける遺伝暗号の類似性から、全生物の最後の共通祖先LUCAで、現在のアミノ酸20種を使用する標準暗号が確立していたと考えられている。LUCA以前の原始生命では、翻訳に20種以下のアミノ酸しか利用しなかったかもしれないが、他のアミノ酸が付け加えられ、最終的に20種のアミノ酸を利用するようになったのであろう。このセッションでは、現在の遺伝暗号システムが初期生命において如何に構築されたか、起源に迫ることを目指し包括的に議論する。

１．「マジック２０の禁制律」
　　大島泰郎（共和化工）

２．「tRNA修飾酵素が主導する遺伝暗号の進化」
　　別所義隆（理研・SPring-8）

３．「動物ミトコンドリアの遺伝暗号の多様性」
　　渡辺公綱（東大）

４．「アミノアシルtRNA合成酵素の生命ゲノム進化」
　　横堀伸一（東京薬科大・生命科学）

５．「真核生物の変則tRNA遺伝子群」
　　金井昭夫（慶應義塾大・先端生命）

６．「遺伝暗号解読のメカニズム」
　　��井和幸（愛媛大・理工）

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　負の種間相互作用である繁殖干渉は、近縁種間の地理分布やニッチ利用といった生態現象に影響を与えることが知られている。それと同時に、異種のオスとメスが関わる行動のため、生殖隔離の強化、形質置換、性的対立、有性・単為生殖の維持といった、進化生物学における重要な概念とも密接に関連しているはずである。しかし、繁殖干渉が生じる進化的な背景、および繁殖干渉がもたらす進化的な帰結については、理論的な検討が不十分であり、明示的な実証研究も多くない。このワークショップでは、進化に関わる繁殖干渉の新たな知見を提供することにより、上記トピックの諸問題の解決に貢献したい。

１．「繁殖干渉と隔離強化、形質置換、種分化」
　　小沼順二（京大・動物生態）

２．「テントウムシにおける寄主特殊化と生態的形質置換」
　　鈴木紀之（東北大・生命科学）

３．「繁殖が‘干渉’になる理由を探る：単為・有性生殖間の競争を例として」
　　川津一隆（京大・昆虫生態）

４．「コメント」
　　千葉　聡（東北大・生命科学）

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　日本進化学の叡智を結集した進化学事典が、本年4月に共立出版より発売された。これを機会に、事典に記されたいくつかの項目に焦点をあて、進化学のこれからに想像を膨らませようというのが本企画の趣旨である。ワークショップ前半は５名の演者による講演を予定している。まずは執筆者から３名が、担当した項目の解説を中心に、書ききれなかった内容や今後発展するであろう知見について講演する。共立出版編集部からも御参加いただき、「事典」を編集出版するということについて、出版社の立場からの意見を話していただけることになった。さらに国立遺伝学研究所の太田朋子名誉教授から、進化に対する考え方がどのように変遷してきたかを講演いただく予定だ。
　後半は４名のオーガナイザーを中心に、講演者および聴衆を交えての座談会を行う。進化学分野にもたらされてきたパラダイムシフトの概要や、今後どのように発展していくかについて広く意見を交わす機会をもうけ、人類の叡智が積み上げられていくところを目の当たりにできるようなセッションにしたい。

１．「進化学事典の「真核生物のゲノム」項目における書き残し」
　　川島武士（沖縄科学技術大）
　　(執筆項目 「8.3 平板動物門」「18.3 真核生物のゲノム」)

２．「脊索動物の起源解明の現在と展望」
　　宮本教生（海洋研究開発機構）
　　（執筆項目「10.8 脊索動物」)

３．「進化学における古生物学の立ち位置」
　　遠藤一佳（東大・院理）
　　（執筆項目「7.9 古生物学の知見から」「8.12 腕足動物」「14.3 古代DNA」
　　「14.5地球環境の変動と生命史」）

【編集部講演】
４．「事典出版よもやま話」
　　山本藍子・野口訓子（共立出版）

【特別講演】
５．「ほぼ中立説と発生遺伝学やEpigeneticsの発展」
　　太田朋子（遺伝研）

【座談会】
６．「『進化学事典』を囲みこれまでの進化学とこれからの進化学に思いをはせる」
　　川島武士、吉田真明、尾内隆行、宮本教生、遠藤一佳、太田朋子、他

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　近年，化石試料から生物学的情報を抽出する手法が急速に多様化し，地球科学で従来から用いられてきた地球化学や鉱物学をはじめとする物質科学的なアプローチや，バイオメカニクスやシミュレーションなどを利用した解析技法が普及・常套化してきた．本ワークショップでは，古生物の生態学的・生理学的情報について，古環境などの状況証拠からの間接的推定ではなく，様々な手法を駆使して化石標本から直接的に復元した事例研究を紹介するとともに，それらの情報源からどのような進化古生物学的研究が展開できるかについて議論したい．

１．「殻体の安定同位体組成から探る絶滅生物の生態とその進化」
　　守屋和佳（金沢大）

２．「体色の進化史復元は可能か：化石からの色彩情報抽出の試み」
　　石川牧子（東大）

３．「化石から紐解く古生物の視覚とその進化」
　　田中源吾（群馬県博）

４．「比較結晶学から探る古生物の殻形成過程とその系統性」
　　生形貴男（静岡大）

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　遺伝子発現の変化は、個々の遺伝子レベル、またはゲノムレベルで、様々な相互作用の変化をもたらす。このようなゲノムや遺伝子間の相互作用を介して起こるいくつかの興味深い生命現象について、遺伝子発現のノイズやアレル間の差など、詳細な解析例について議論することで、発現調節機構やゲノムレベルの遺伝子発現ネットワークの背景にある進化機構に迫る。

１．「ショウジョウバエ自然集団内アレルサンプルを用いた遺伝子発現解析」
　　高橋文（首都大・生命科学）

２．「ヒトとチンパンジーにおけるアリル特異的発現遺伝子の同定と遺伝子発現制御機構の進化」
　　郷　康広（京大・霊長類研）

３．「亜種間ハイブリッドマウスにおける遺伝子発現のアレル間差異」
　　沼田興治（理研・バイオリソース）

４．「Gsxホメオボックス遺伝子のパラロガス転写調節領域の機能と進化」
　　隅山健太（遺伝研・集団遺伝）

５．「パラログ形成にともなうシス調節機構の進化」
　　越智陽城（奈良先端大・発生ゲノミクス）

（共催：新学術領域　ゲノム・遺伝子相関）

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　有性生殖は広範な動物分類群で保存された現象であるにも拘らず，「性」の決定様式とそれに続く分化様式は極めて多様である．特に節足動物では，遺伝的性決定だけでなく，単数倍数性に従う性決定や環境依存的性決定，寄生生物に依存した性決定の様式が知られる．また，別種と思えるほど顕著な性的二型を示す分類群も珍しくない．本集会では節足動物に注目し，このように性決定・性分化様式の多様化をもたらした進化機構に迫る．

１．「カイコにおける遺伝的性決定機構」
　　鈴木雅京（東大・新領域創成科学）

２．「共生細菌にのっとられたアズキノメイガの性決定機構」
　　杉本貴史（富山大・先端ライフサイエンス）

３．「トゲオオハリアリにおける顕著な性分化過程」
　　宮崎智史（富山大・理）

４．「ミジンコにおける環境依存的な性決定機構」
　　加藤泰彦（阪大・工）

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　托卵鳥とその宿主の間の攻防戦は，古くから軍拡競争型共進化の好例として注目されてきた．その結果，理論から実証に至るさまざまな研究が行われ，多くの謎が解明されてきた．とはいえ，現在でもその全貌が明らかになったわけではなく，中には明快な答えの無いままうやむやにされてしまったような“謎”も少なからず存在する．本ワークショップではそのような謎を，宿主の生活史戦略という観点から解き明かす最新の研究を紹介する．

１．「宿主によるカッコウ雛排除行動の発見とその適応的意義〜卵の数が対托卵防衛戦術に影響するか！？〜」
　　^◯佐藤　望（立教大・理），三上　修（岩手医科大），上田恵介（立教大・理）

２．「宿主の学習によるカッコウ雛の排除は可能か？〜カッコウ卵の孵化タイミングが宿主に学習機会を与える！〜」
　　佐藤 望（立教大・理），^◯田中啓太（立教大・理），三上　修（岩手医科大），上田恵介（立教大・理）

３．「カッコウによる巧みな宿主操作〜カッコウによる宿主卵の抜き取りが宿主の排除行動をためらわせる〜」
　　三上　修，^◯三上かつら（バードリサーチ），田中啓太（立教大・理），佐藤　望，上田恵介（立教大・理）

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　海洋における生命進化と環境変遷のつながりは，地球生命圏を理解する上で非常に重要である．広く海洋に生息し，かつ殻骨格を形成する有孔虫・放散虫は，カンブリア紀以降の化石記録を有する原生生物である．これら生物の進化系統学的研究は形態と遺伝子の両面で行われており，特に有孔虫では，殻の化学組成による生息環境復元の研究が行われている．本セッションでは，これらの最先端の研究成果を紹介し，今後の生物—地球科学の学際的研究の発展をはかる．

１．「放散虫Spumellaria目の進化系統とその内部構造の比較」
　　石谷佳之（海洋研究開発機構）

２．「放散虫化石Stichocorys peregrinaの形態変化」
　　上栗伸一（茨城大・教育）

３．「有孔虫類の多様化メカニズムの解明に向けて」
　　土屋正史（海洋研究開発機構・海洋・極限環境生物圏）

４．「形態から読み解く浮遊性有孔虫と環境の共進化」
　　木元克典（海洋研究開発機構・地球環境変動）

５．まとめ
　　遠藤一佳（東大）

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